По итогам работы оператора по обслуживанию грузов компании «Интерпорт» грузооборот «Емельяново» в 2012 году вырос в сравнении с 2011 годом на 18%. Обработка международных грузов увеличилась на 45%, внутренних — на 7%. За год в аэропорту были обслужены почти 20 тыс. т грузов и почты. Из них 12,8 тыс. т — внутренние российские грузы, 7 тыс. т — международные. Большая часть грузов была доставлена в багажных отсеках пассажирских самолетов. В сравнении с 2011 годом поток грузов от грузовых авиакомпаний вырос на 48%, от пассажирских — на 5%. После внедрения хабовых технологий в аэропорту в ноябре и декабре 2012 года было обработано 445 т трансферных грузов авиакомпании AirBridgeCargo.